L'intervento chirurgico può essere necessario se l'infezione causa gravi danni alle valvole cardiache, porta a insufficienza cardiaca o non risponde al trattamento antibiotico. Le procedure includono la riparazione o la sostituzione della valvola con protesi meccaniche o biologiche.

I pazienti potrebbero aver bisogno di ulteriori misure di supporto, come la fluidoterapia, l'ossigenoterapia, la gestione del dolore e il trattamento di complicazioni quali embolia o disfunzione d'organo.

Nei rari casi in cui l'endocardite è causata da funghi o virus anziché da batteri, vengono utilizzati farmaci antimicotici o antivirali. Queste infezioni sono spesso più difficili da trattare e possono richiedere periodi di terapia più lunghi.

Dopo il trattamento iniziale, sono essenziali controlli regolari per garantire la completa guarigione dell'infezione e per monitorare la funzionalità delle valvole cardiache. Durante la fase di monitoraggio vengono comunemente eseguiti ecocardiogrammi ed esami del sangue.